Caboclo - Repositório Institucional UFRB CCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas PPG-RGV - Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais CCAAB - PPG-RGV - Dissertações
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Tipo de documento: Dissertação
Grau acadêmico: Mestrado Acadêmico
Título: Desenvolvimento de ferramentas moleculares e seleção assistida por marcadores para resistência ao vírus do mosaico africano na cultura da mandioca
Autor(es): Carmo, Catia dias do
Orientador(a): Oliveira, Eder Jorge de
Membro(a) da banca: Silva, Carlos Bernard Moreno Cerqueira
Membro(a) da banca: Silva, Simone Alves
Referência: CARMO, Catia dias do. Desenvolvimento de ferramentas moleculares e seleção assistida por marcadores para resistência ao vírus do mosaico africano na cultura da mandioca. 2014. 112 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Recursos Genéticos Vegetais) - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas, Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, 2014.
Resumo: Este trabalho teve como objetivo desenvolver e caracterizar marcadores do tipo TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) na cultura da mandioca (Manihot esculenta Crantz), bem como selecionar acessos com genes de resistência ao vírus do mosaico africano via seleção assistida por marcadores (SAM). Foram desenvolvidos e validados iniciadores TRAP com alto polimorfismo, baixo custo operacional e fácil implementação. Das 396 combinações, as 69 mais polimórficas foram utilizadas na caracterização de 46 acessos de germoplasma, cujos valores de conteúdo de informação polimórfica e poder de resolução foram maiores que 0,25 e 3,21, respectivamente. Estes TRAPs estão associados a regiões gênicas relacionadas a biossíntese de amido, carotenoides, compostos cianogênicos, deterioração fisiológica pós-colheita, formação de raízes tuberosas e respostas de defesa. Em relação à identificação de fontes de resistência ao CMD foram identificados sete acessos que apresentaram alelos ligados ao gene CMD2. A análise discriminante de componentes principais (ADCP) das sete fontes de resistência ao CMD juntamente com 17 variedades elite de mandioca indicou a formação de três grupos de divergência, na qual as fontes de resistência ao CMD foram alocadas em dois diferentes grupos. As baixas estimativas de parentesco genômico (variação de -0,167 a 0,681, média de 0,076), contribuíram para o sucesso na orientação de cruzamentos contrastantes para geração de populações segregantes.
Palavras-chave: Mandioca - Manihot esculenta Crantz - Doenças e pragas
Mandioca - Vírus do mosaico africano
Diversidade genética - Marcadores moleculares
Seleção Assistida - Resistência
Resumo em inglês: This study aimed to develop and characterize TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) markers in cassava (Manihot esculenta Crantz) as well as select accessions with genes related to the resistance to Cassava Mosaic Disease (CMD) through marker-assisted selection (MAS). TRAP markers with high polymorphism, low operating cost and easy implementation were developed and validated. From 396 combinations, the 69 most polymorphic were used to characterize 46 germplasm accessions whose polymorphic information content and resolving power values were greater than 0.25 and 3.21, respectively. These TRAPs are associated with genic regions related to starch and carotenoids biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation and defense responses. Regarding the identification of CMD resistance sources, seven accessions which presented alleles linked to CMD2 gene were identified. The discriminant analysis of principal components (DAPC) of the seven CMD resistance sources along with 17 elite cassava varieties indicated the formation of three divergence groups in which the CMD resistance sources were divided into two different groups. The low estimates for genomic relatedness (range -0.167 to 0.681, average 0.076), contributed to the successful orientation of contrasting crosses to generate segregating populations.
Palavras-chave em inglês: Cassava - Manihot esculenta Crantz - Diseases and pests
Cassava - African mosaic virus
Genetic diversity - Molecular markers
Assisted Selection - Resistance
Editora / Instituição: Universidade Federal do Recôncavo da Bahia
Centro de Ensino: CCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas
Programa de pós-graduação: Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais
Data do documento: Jul-2014
CNPq: CNPQ:CIÊNCIAS AGRÁRIAS
Tipo de acesso: Acesso Aberto
Acesso Disponível em: 2016-01-21
URI: http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/939
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