Caboclo - Repositório Institucional UFRB CCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas PPG-RGV - Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais CCAAB - PPG-RGV - Dissertações
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dc.creatorMatos, Edneide Luciana Santiago-
dc.date.available2013-09-22-
dc.date.issued2010-05-
dc.identifier.citationMATOS, Edneide Luciana Santiago. Caracterização molecular de acessos de mamoeiro com uso de marcadores microssatélites. 2010. 69 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Recursos Genéticos Vegetais) - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas, Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, 2010.pt_BR
dc.identifier.urihttp://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/678-
dc.description.abstractThe papaya tree is found in almost every country of tropical America and Brazil is ranked as the world's leading producer, contributing with 25% of the market. The objective of this study was to evaluate 96 papaya accessions from the Papaya Active Germplasm Bank (Papaya-AGB) of Embrapa Cassava and Tropical Fruits (CNPMF) by molecular characterization using microsatellites markers. For genomic DNA extraction the Doyle & Doyle method with some modifications was used. Fifteen polymorphic primer pairs were selected. DNA fragments generated with each microsatellite primer pair were separated in 1000-3% agarose gels stained with ethidium bromide and in 6% polyacrylamide denaturating gels stained with silver nitrate. The size of the polymorphic loci was determined by comparison with the 50-bp mass ruler. The accessions were evaluated for allele frequencies, heterozygosity, polymorphism information content (PIC), inbreeding index and structure of genetic diversity. The 15 primer pairs amplified 68 alleles. The mean number of alleles per locus (NA) was 4.5. The PIC values ranged from 0.189 to 0.691 with the highest value found for primer CP16. The observed heterozygosity (Ho) was lower than the expected heterozygosity (HE), for all selected microsatellites loci. The high estimate of inbreeding index (0.672) and excess of homozygotes detected, indicate the presence of inbreeding among the accessions analyzed. The genetic structure inferred from the dendrogram generated with the genetic distance matrix showed 23 groups, what confirms the genetic divergence of the genotypes and the potential to increase genetic variability by developing new varieties.en
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal do Recôncavo da Bahiapt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectMamoeiro - Carica papaya L.pt_BR
dc.subjectMamão - Polimorfismopt_BR
dc.subjectMamão - Recursos genéticospt_BR
dc.subjectCaracterização molecular - Marcadores microssatélitespt_BR
dc.titleCaracterização molecular de acessos de mamoeiro com uso de marcadores microssatélitespt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR
dc.description.resumoO mamoeiro é uma fruteira encontrada em quase todos os países da America Tropical, sendo o Brasil classificado como principal produtor mundial da fruta, participando com 25% do mercado mundial. O objetivo do trabalho foi avaliar 96 acessos de mamoeiros provenientes do Banco Ativo de Germoplasma de Mamão (BAG-Mamão), da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical (CNPMF), por meio da caracterização molecular com o uso de marcadores microssatélites. Para a extração do DNA genômico foi aplicado o método de Doyle & Doyle com algumas modificações. Foram selecionados 15 iniciadores polimórficos. Para a técnica de microssatélites, os fragmentos de DNA gerados com cada iniciador foram avaliados em géis de agarose 1000 a 3%, corados com brometo de etídio ou em géis desnaturantes de poliacrilamida 6%, corados com nitrato de prata. O peso molecular dos locos polimórficos foi determinado por comparação com um padrão de peso molecular de 50 pb (New England Biolabs). Os acessos foram avaliados quanto às frequências alélicas, à heterozigosidade, o conteúdo informativo de polimorfismo (PIC), o coeficiente de endogamia e quanto à estruturação da diversidade genética. Os 15 pares de iniciadores amplificaram 68 alelos. A média do número de alelos por loco (NA) foi 4,5. O PIC apresentou valores variando de 0,189 a 0,691 sendo o maior valor encontrado para o iniciador CP16. Para todos os locos de microssatélites selecionados a heterozigosidade observada (HO) foi menor que a esperada (HE). O alto índice médio de endogamia estimado (0,672) e o excesso de homozigotos detectados indicam a existência de endogamia entre os acessos analisados. A análise da estruturação genética a partir do dendograma gerado pela matriz de distância genética permitiu a formação de 23 grupos, evidenciando a divergência genética dos genótipos e potencialidades para aumentar a variabilidade genética por meio do desenvolvimento de novas variedades.pt_BR
dc.degree.levelMestrado Acadêmicopt_BR
dc.contributor.advisor1Dantas, Jorge Luiz Loyola-
dc.contributor.advisor-co1Oliveira, Eder Jorge de-
dc.contributor.referee1Silva, Simone Alves-
dc.contributor.referee2Queiroz, Sandra Regina de Oliveira Domingos-
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentCCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicaspt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetaispt_BR
dc.publisher.initialsUFRBpt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ:CIÊNCIAS AGRÁRIASpt_BR
dc.subject.enPapaya tree - Carica papaya L.en
dc.subject.enPapaya - Polymorphismen
dc.subject.enPapaya - Genetic resourcesen
dc.subject.enMolecular characterization - Microsatellite markersen
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