Caboclo - Repositório Institucional UFRB CCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas PPG-RGV - Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais CCAAB - PPG-RGV - Dissertações
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Tipo de documento: Dissertação
Grau acadêmico: Mestrado Acadêmico
Título: Caracterização molecular de acessos de mamoeiro com uso de marcadores microssatélites
Autor(es): Matos, Edneide Luciana Santiago
Orientador(a): Dantas, Jorge Luiz Loyola
Coorientador(a): Oliveira, Eder Jorge de
Membro(a) da banca: Silva, Simone Alves
Membro(a) da banca: Queiroz, Sandra Regina de Oliveira Domingos
Referência: MATOS, Edneide Luciana Santiago. Caracterização molecular de acessos de mamoeiro com uso de marcadores microssatélites. 2010. 69 f. Dissertação (Mestrado Acadêmico em Recursos Genéticos Vegetais) - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas, Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, 2010.
Resumo: O mamoeiro é uma fruteira encontrada em quase todos os países da America Tropical, sendo o Brasil classificado como principal produtor mundial da fruta, participando com 25% do mercado mundial. O objetivo do trabalho foi avaliar 96 acessos de mamoeiros provenientes do Banco Ativo de Germoplasma de Mamão (BAG-Mamão), da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical (CNPMF), por meio da caracterização molecular com o uso de marcadores microssatélites. Para a extração do DNA genômico foi aplicado o método de Doyle & Doyle com algumas modificações. Foram selecionados 15 iniciadores polimórficos. Para a técnica de microssatélites, os fragmentos de DNA gerados com cada iniciador foram avaliados em géis de agarose 1000 a 3%, corados com brometo de etídio ou em géis desnaturantes de poliacrilamida 6%, corados com nitrato de prata. O peso molecular dos locos polimórficos foi determinado por comparação com um padrão de peso molecular de 50 pb (New England Biolabs). Os acessos foram avaliados quanto às frequências alélicas, à heterozigosidade, o conteúdo informativo de polimorfismo (PIC), o coeficiente de endogamia e quanto à estruturação da diversidade genética. Os 15 pares de iniciadores amplificaram 68 alelos. A média do número de alelos por loco (NA) foi 4,5. O PIC apresentou valores variando de 0,189 a 0,691 sendo o maior valor encontrado para o iniciador CP16. Para todos os locos de microssatélites selecionados a heterozigosidade observada (HO) foi menor que a esperada (HE). O alto índice médio de endogamia estimado (0,672) e o excesso de homozigotos detectados indicam a existência de endogamia entre os acessos analisados. A análise da estruturação genética a partir do dendograma gerado pela matriz de distância genética permitiu a formação de 23 grupos, evidenciando a divergência genética dos genótipos e potencialidades para aumentar a variabilidade genética por meio do desenvolvimento de novas variedades.
Palavras-chave: Mamoeiro - Carica papaya L.
Mamão - Polimorfismo
Mamão - Recursos genéticos
Caracterização molecular - Marcadores microssatélites
Resumo em inglês: The papaya tree is found in almost every country of tropical America and Brazil is ranked as the world's leading producer, contributing with 25% of the market. The objective of this study was to evaluate 96 papaya accessions from the Papaya Active Germplasm Bank (Papaya-AGB) of Embrapa Cassava and Tropical Fruits (CNPMF) by molecular characterization using microsatellites markers. For genomic DNA extraction the Doyle & Doyle method with some modifications was used. Fifteen polymorphic primer pairs were selected. DNA fragments generated with each microsatellite primer pair were separated in 1000-3% agarose gels stained with ethidium bromide and in 6% polyacrylamide denaturating gels stained with silver nitrate. The size of the polymorphic loci was determined by comparison with the 50-bp mass ruler. The accessions were evaluated for allele frequencies, heterozygosity, polymorphism information content (PIC), inbreeding index and structure of genetic diversity. The 15 primer pairs amplified 68 alleles. The mean number of alleles per locus (NA) was 4.5. The PIC values ranged from 0.189 to 0.691 with the highest value found for primer CP16. The observed heterozygosity (Ho) was lower than the expected heterozygosity (HE), for all selected microsatellites loci. The high estimate of inbreeding index (0.672) and excess of homozygotes detected, indicate the presence of inbreeding among the accessions analyzed. The genetic structure inferred from the dendrogram generated with the genetic distance matrix showed 23 groups, what confirms the genetic divergence of the genotypes and the potential to increase genetic variability by developing new varieties.
Palavras-chave em inglês: Papaya tree - Carica papaya L.
Papaya - Polymorphism
Papaya - Genetic resources
Molecular characterization - Microsatellite markers
Editora / Instituição: Universidade Federal do Recôncavo da Bahia
Centro de Ensino: CCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas
Programa de pós-graduação: Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais
Data do documento: Mai-2010
CNPq: CNPQ:CIÊNCIAS AGRÁRIAS
Tipo de acesso: Acesso Aberto
Acesso Disponível em: 2013-09-22
URI: http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/678
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